Так действуйте с бухгалтером в тандеме! Он должет знать, какие проводки формирует то или иное начисление, а вы теперь знаете, где их настраивать. Обязательно настройте проводки у всех видов начислений (и удержаний, в том числе налогов), которые используются на предприятии или планируется использовать и установите основную проводку по умолчанию(Сервис--Настройки--Зарплата и бухучет). Кроме этого, если есть необходимость, можно присвоить проводки отдельным сотрудникам (в карточке сотрудника), подразделению (в справочнике подразделений) или в отдельном документе (на закладке Бухучет). И после того, как за расчетный период будут введены все начисления, удержания, рассчитана зарплата и налоги - можете составить Свод проводок и просмотреть результат своего труда.