В письме от 24.03.2014 № 03-03-06/1/12690 Минфин России рассмотрел вопрос о том, может ли комитент учесть для целей налогообложения прибыли расходы на ретроспективные премии, которые предоставляет покупателям комиссионер (за счет комитента) в рамках договора комиссии.

Данный вывод содержится в письме Минфина России от 17.01.2014 № 03-11-11/1349.

Такая позиция изложена в письме Минфина России от 07.10.2013 № 03-11-06/2/41436.

В письме от 27.07.2012 № 03-07-09/92 Минфин России рассмотрел вопрос о том, как составлять и хранить счета-фактуры при приобретении или реализации товаров (работ, услуг) через комиссионера (агента).

В письме от 02.03.2012 № 03-07-09/16 Минфин России разъяснил порядок оформления счетов-фактур по работам, услугам, приобретаемым комиссионером от своего имени, но за счет комитента.

В письме от 17.11.2011 № 03-07-11/316 Минфин России разъяснил порядок оформления счетов-фактур при оказании услуг по договору транспортной экспедиции.

В договоре комиссии может быть предусмотрено право комиссионера удерживать вознаграждение из денежных средств, поступивших от покупателей товара и причитающихся комитенту. При этом размер комиссионного вознаграждения может определяться как разница между ценой товара, назначенной комитентом и указанной в накладной, и фактической ценой его реализации (если сделка совершается на более выгодных условиях). В письме от 10.10.2011 № 03-03-06/1/641 Минфин России рассмотрел вопрос о том, как комитенту учитывать выручку в такой ситуации: отражать в доходах фактическую цену, по которой были проданы товары, а в расходах – сумму удержанного комиссионером вознаграждения, или же включать в доходы только цену, назначенную комитентом.

Комиссионая торговля может подпадать под ЕНВД. Указанный вывод изложен в письме Минфина России от 06.10.2009 № 03-11-09/336.

Минфин России выпустил новый документ, содержащий несколько важных выводов для организаций, работающих по договору комиссии (письмо от 07.08.2009 № 03-03-06/1/521). В частности, в письме указано следующее. Курсовые разницы (как положительные, так и отрицательные), возникающие по сумме аванса в иностранной валюте, купленной комиссионером за счет средств комитента и перечисленной поставщику в связи с исполнением поручения комитента, отражаются в налоговом учете комитента. Подробнее обозначенная проблема рассмотрена в статье "Бухгалтерский и налоговый учет курсовых разниц у посредника".

Минфин России в письме от 28.05.2009 № 03-07-09/26 разъяснил, что выставляя комитенту счет-фактуру по товарам, работам, услугам, приобретенным от своего имени, комиссионер должен указывать дату выписки, соответствующую дате выписки счета-фактуры, выданного ему продавцом.