В юридических лицах (фирмах) на закладке учетная политика есть вариант использования НДС и НП.
Для одной фирмы Вы ставите НДС и НП учитывать, а для другой нет.
В типе цен ставите, что налоги включены в цену.
При продаже товара от имени первой фирмы будет установлена продажа с НДС и НП, и цена будет, например, 10 руб., а для второй фирмы будет продажа без НДС и НП, но при подборе цена тоже будет равна 10 руб.