Организация является плательщиком НДС, но совершает операции, не облагаемые или освобожденные от НДС. В Учетной политике был ошибочно установлен флаг Организация освобождена от уплаты НДС. По этой причине реализация без НДС автоматически попала в 12 раздел декларации.
В соответствии с изменениями, внесенными в Постановление от 26.12.2011 №1137, операции, освобожденные от НДС, не включаются в книгу продаж. Нужно снять флаг в учетной политике Организация освобождена от уплаты НДС и перепровести операции по реализации.