почему нет события "пометка на удаление" в журнале регистрации

Пометка на удаление ни чем не отличается от изменения какого-нибудь другого реквизита, а регистрация изменений реквизитов совсем другими средствами делается. Поэтому для ЖР действие пометки на удаление будет в любом случае выглядеть как "Запись" и "Отмена проведения". Кстати, не так-то уж и сложно дополнить типовую конфигурацию отдельным фиксированием события пометки на удаления, но это нужно программировать.