Слетают итоги

Andrei Gorshkov, так может у вас там вечером какая-то обработка запускается, которая отключает предварительно итоги, а вы в этот момент "гасите" сервер. Зачем его вообще перезагружать? Тестировать базу не пробовали?

обработки не запускаются, все регламентные задания в базе отключены.

тестировать пробовали, тестирование говорит - "всё ОК".
сервер перезагружается не каждый день, но с определенной периодичностью с целью например установки обновлений винды.