Тэра, удержано у сотрудника - это разница между начислениями и удержанием НДФЛ, ну, или сумма удержания НДФЛ у сотрудника при начислении зарплаты в регистре "НДФЛ расчеты с бюджетом". Сумы удержания из выплаты сотрудникам ведь исключаются. Это как раз исчисленный НДФЛ, который отложен для уплаты в бюджет при фактической выплате заработной платы. И отложен он из начисленной зарплаты, т.е. дохода налогоплательщика.
По удержанию с натурдохода - придётся или увеличивать расходы на выплату аванса на величину такого НДФЛ или, что я считаю правильнее, уменьшить выплату аванса на эту сумму. НДФЛ ведь из дохода сотрудника нужно уплатить, а вдруг он уволится без начислений, с которых можно было бы дополнительно удержать этот НДФЛ.