ЗУП требует перерассчитать начисления прошлых периодов

Перерасчет требуется тогда, когда изменились размеры (или был перерасчет) начислений, входящих в базу того, что просит перерасчитать. Например, рассчитали отпуск, потом зарплату. Потом вспомнили, что премию забыли перерассчитать по новому проценту. Зашли, перерасчитали. А средний для отпуска забыли. Вот она вам и напоминает. Как-то так...
В любом случае, советы верные. Надо найти документ, с которого начинаются просьбы о перерасчете.
И в будущем соблюдать последовательность расчета зарплаты.