Сотрудникам определить один вид начислений, например по часовому тарифу (Это на 2012 г) Вводите табель, и если были, делаете необходимые начисления по среднему, другие необлагаемые взносами, и в этих документах потом руками правите суммы на такие, какие должны быть. Затем делаете начисление за январь 2012 и руками правите часы, начисление на такие, какие они прошли в вашем учете. Затем расчет налогов. Проверяете, должно сходиться. Вычеты, если есть, задаете с января 2012г. Так по всем месяцам. Это для расчета среднего при командировках, отпусках. По б.л в 2013 г. можно будет дописывать заработок за 2011 год. Начальное сальдо по налогам вводите документом (кажется корректировка учета по НДФЛ, страховым взносам и ЕСН, тот компьютер, где все делала, нет возможности посмотреть, но это прописано в книжке из коробки по 1С). Последним днем года прекращаете, если нужно, это начисление и вводите с 1 числа все необходимые основные и доп начисления. смотрите, чтобы в базу для начисления ср. заработка попало это начисление за 1012г. первый квартал лучше начислять зарплату в 1С и по старому, чтобы исключить ошибки. Это подходит для тех случаев, когда начисление не слишком сложное и сотрудников мало. Я по 10 сотрудникам все "ослила", учитывая, что 1с 8 ку ЗУП начинала с нуля, дня за 2. Начисления же за 13 год, если начисления уже делали в другой программе, должны быть идентичны по видам начислений. Оплату налогов тоже нужно разнести, ведомости провести, сделав упрощенный вид взаимозачетов.