Как избавиться от сальдо на сч.68.32

Без обид! Это же была шутка!

joper,
У всех с/ф с копейками.  И в книгу покупок /продаж попадет с копейками.  Не сумму НДС вы должны править в с/ф, а платежке на перечисление НДС указать сумму  5179. И до закрытия последнего месяца в квартале у  вас на 68.32  будет висеть что вы перечислили больше чем надо. А закрытие месяца вам как раз и "доначислит" ДТ 99 Кт 68.32 .
Программа отрабатывает все правильно.

P.S. У вас в декларации по НДС в разделе 2 будет сумму без копеек ( например за 1 квартал  5179*3=15357) . Так что - платите.