pavlika, зечем нормальному родителю брать больничный на выходные и на отпуск - не понятно.
Уточните постановку задачи: как вы считаете, сотрудник отпуск отгулял или нет? Если нет - сторнируете отпуск, проводите больничный. Если отгулял ( как неявно следует из вашего вопроса) - поставьте в больничном правильные даты периода оплаты ( суббота-воскресенье)