Организация, арендующая нежилое помещение у физического лица, признается налоговым агентом по НДФЛ (письмо Минфина России от 03.06.2009 № 03-04-05-01/428).
Российские организации, от которых или в результате отношений с которыми физическое лицо получило доходы, облагаемые НДФЛ, обязаны исчислить, удержать у налогоплательщика и перечислить в бюджет сумму данного налога (п.1, п. 2 ст. 226 НК РФ). Данная обязанность не распространяется лишь на доходы, в отношении которых НДФЛ исчисляется и уплачивается соответствии со статьями 214.1, 227 и 228 НК РФ зачетом ранее удержанных сумм налога.
Из вышеизложенного финансисты и сделали вывод о том, что организация, производящая выплаты физическому лицу в соответствии с заключенным договором аренды нежилого помещения, признается налоговым агентом по НДФЛ в отношении арендной платы, и должна исчислить, удержать и перечислить в бюджет налог с этих сумм.