Досудебная процедура урегулирования спора в отношении решений налогового органа об отказе в возмещении сумм НДС не предусмотрена. Такой вывод изложен в постановлении ФАС Западно-Сибирского округа от 07.06.2010 по делу № А70-8626/2009.
Согласно пункту 5 статьи 101.2 НК РФ решение о привлечении к ответственности за совершение налогового правонарушения или решение об отказе в привлечении к ответственности за совершение налогового правонарушения может быть обжаловано в судебном порядке только после обжалования в вышестоящем налоговом органе. Из буквального толкования данной нормы следует, что применять ее к случаю отказа налогового органа в возмещении НДС не стоит. Налогоплательщик мог сразу обратиться в суд.
Отметим, что имеются и другие арбитражные решения, подтверждающие данный подход (см., например, постановление ФАС Московского округа от 27.04.2010 № КА-А40/4006-10).