Перечень случаев, когда НДС необходимо восстановить, приведен в п. 3 ст. 170 НК РФ и является исчерпывающим. Указанная норма не содержит обязанности налогоплательщика восстановить НДС при порче приобретенного товара.
Вместе с этим налогоплательщик вправе принять к вычету сумму НДС, предъявленную продавцами товаров (работ, услуг), если они используются в операциях, облагаемых НДС (п. 2 ст. 171 НК РФ).
Следовательно, сумма НДС по товарам, не используемым в операциях, облагаемых НДС, вычету не подлежит.
Данные разъяснения приведены в письме Минфина России от 19.03.2015 № 03-07-11/15015.
Вывод: ранее принятые к вычету суммы "входного" НДС по имуществу, пришедшему в негодность, следует восстановить.
Источник its.1c.ru