Согласно разъяснениям Минфина России, данным в письме от 06.04.2009 № 03-11-09/124, доход, полученный индивидуальным предпринимателем-"упрощенцем" от продажи нежилого здания, которое не использовалось им в предпринимательской деятельности, облагаемой единым налогом при УСН, является объектом обложения НДФЛ. При этом предприниматель уже как обычное физическое лицо вправе применить при продаже нежилого здания имущественный налоговый вычет, установленный подпунктом 1 пункта 1 статьи 220 НК РФ.
Данное разъяснение финансистов следует из действующих принципов налогообложения в РФ, согласно которым учет доходов, полученных от осуществления предпринимательской деятельности, а также учет доходов, полученных вне рамок осуществления такой деятельности, должен производиться раздельно.