Минфин РФ в своем письме от 06.07.2016 № 03-04-10/39533 пояснил порядок возврата излишне удержанного НДФЛ.
В письме отмечается, что возврат излишне удержанного НДФЛ производится налоговым агентом за счет сумм этого налога, подлежащих перечислению в бюджет, в течение 3 месяцев после получения заявления налогоплательщика.
Возврат излишне удержанного НДФЛ производится налоговым органом только при отсутствии налогового агента. В этом случае налогоплательщик подает заявление в налоговый орган о возврате НДФЛ одновременно с декларацией 3-НДФЛ после окончания налогового периода.
Таким образом, при наличии налогового агента, удержавшего НДФЛ, налоговый орган не может произвести возврат излишне удержанного агентом суммы налога. При этом возврат такого НДФЛ иным налоговым агентом также не предусмотрен.