Минфин России в письме от 06.03.2008 № 03-03-06/1/152 разъяснил, что включить в расходы арендные платежи за арендованный участок можно только после государственной регистрации договора.
Обязательная регистрация таких договоров предусмотрена пунктом 2 статьи 609 ГК РФ.
Подробнее о связи между госрегистрацией прав на недвижимость и налогообложением читайте здесь.
Также будет интересно мнение Минфина России относительно порядка уплаты земельного налога.