Минфин России в письме от 04.05.2016 № 03-07-09/25719 отметил, что при доставке товаров обособленному подразделению организации в счете-фактуре продавец указывает:
- в строке 4 "Грузополучатель и его адрес" – наименование и адрес обособленного подразделения,
- в строках 6 "Покупатель" и 6а "Адрес" – данные головной организации,
- в строке 6б "ИНН/КПП покупателя" – КПП обособленного подразделения.
Такой порядок следует из п. 1 Правил заполнения счета-фактуры.
Данные разъяснения поддерживается в учетных решениях "1С:Предприятия 8".
Подробнее о выставлении счета-фактуры в адрес обособленного подразделения см. в справочнике "Налог на добавленную стоимость" (возможен бесплатный тестовый доступ на 7 дней).