Уплата НДС лицу, не являющемуся плательщиком этого налога, не является обстоятельством, исключающим право предъявить спорные суммы налога по счетам-фактурам к вычету. Об этом сказано в постановлении ФАС Дальневосточного округа от 07.09.2010 № Ф03-6028/2010.
Данное решение суд принял, проанализировав правоотношения плательщика НДС с лицом, применяющим специальный налоговый режим (УСН). Отметим, что позиции контролирующих ведомств указанный подход не соответствует. Например, в письме ФНС России от 06.05.2008 № 03-1-03/1925 сказано, что принять сумму налога к вычету в данной ситуации нельзя. Подробнее см. здесь.
Вместе с тем есть и другие арбитражные решения, подтверждающие данный подход.