Пени за просрочку поставки товара являются внереализационным доходом бюджетного учреждения и согласно статье 321.1 НК РФ подлежат учету при определении налоговой базы по налогу на прибыль организаций. Это подтверждается в письме Минфина России от 24.03.2010 № 03-03-06/4/30.
Аргументация в документе приведена следующая. В соответствии с пунктом 3 статьи 250 НК РФ доходы в виде признанных должником или подлежащих уплате должником на основании решения суда, вступившего в законную силу, штрафов, пеней и (или) иных санкций за нарушение договорных обязательств, а также сумм возмещения убытков или ущерба в целях налогообложения прибыли относятся к внереализационным доходам. Положения указанного пункта распространяются, в том числе, и на бюджетные учреждения, участвующие в договорных отношениях.
О других аспектах учета при осуществлении учреждением, кроме бюджетной, еще и приносящей доход деятельности см. здесь.
