Расходы на выплату надбавок, обусловленных районным регулированием оплаты труда, надомнику, проживающему в районе Крайнего Севера, могут быть учтены в составе расходов на оплату труда организацией - работодателем, даже если она расположена в местности, не относящейся к районам Крайнего Севера. Об этом сказано в письме Минфина России от 13.11.2010 № 03-03-07/39.
Сказанное относится также к начислениям по районным коэффициентам и коэффициентам за работу в тяжелых природно-климатических условиях, а также надбавкам за непрерывный стаж работы в районах Крайнего Севера и оплате ежегодного дополнительного оплачиваемого отпуска.
Дело в том, что согласно нормам законодательства районные коэффициенты и процентные надбавки к заработной плате применяются, а дополнительные отпуска за работу в районах Крайнего Севера и приравненных к ним местностях предоставляются по месту фактической работы независимо от места нахождения работодателя, с которым работник заключил трудовой договор.
О других особенностях предоставления "северных" льгот см., например, здесь.