В случае, когда произошла пересортица и поставлены товары, которые не указаны в счете-фактуре, Минфин России рекомендует продавцу выставлять не корректировочный, а исправленный счет-фактуру (см. письмо от 16.03.2015 № 03-07-09/13813).
Объясняется это тем, что в графе 1 корректировочного счета-фактуры указывается наименование товаров из графы 1 первоначального счета-фактуры (пп. "а" п. 2 Правил заполнения корректировочного счета-фактуры, утв. постановлением Правительства РФ от 26.12.2011 № 1137).
Однако если в отгрузочном счете-фактуре отсутствует наименование товара, это правило не соблюдается.
Если товары все-таки указаны в счете-фактуре, но их количество не соответствует поставленному (т.е. отгрузили больше или меньше, чем указали в счете-фактуре), продавец должен выставить корректировочный счет-фактуру (см. письма ФНС России от 01.02.2013 № ЕД-4-3/1406@, от 12.03.2012 № ЕД-4-3/4100@, Минфина России от 12.05.2012 № 03-07-09/48, от 27.03.2012 № 03-07-09/29).
В «1С:Предприятии» поддерживается возможность выставления исправленного и корректировочного счета-фактуры, в том числе в виде электронных документов.
