Налоговым законодательством не запрещается выставление счетов-фактур в валюте или в условных денежных единицах. Такой вывод изложен в письме Минфина России от 24.03.2010 № 03-07-09/14.
При этом оплата товаров (работ, услуг, имущественных прав) на территории России должна осуществляться в рублях в сумме, эквивалентной определенной в иностранной валюте или в условных денежных единицах. По указанным счетам-фактурам можно применять вычеты НДС.
Налоговой службой по этому же вопросу ранее высказывалась противоположная позиция (подробнее см. здесь). Для налогоплательщиков, которые станут руководствоваться новым письмом Минфина России, в экономических программах фирмы "1С" реализована возможность оформления счетов-фактур в валюте и в условных единицах.
