Порядок заполнения счета-фактуры устанавливается Правительством РФ (п. 8 ст. 169 НК РФ).
Стоимостные показатели счета-фактуры, в том числе предъявляемая покупателю сумма НДС (графа 8), указываются в рублях и копейках или в иной валюте (п. 3 Правил заполнения счета-фактуры, утв. постановлением Правительства РФ от 26.12.2011 № 1137).
В связи с чем правило об округлении суммы налога, предусмотренное п. 6 ст. 52 НК РФ, при заполнении счета-фактуры не применяется.
Такие выводы содержатся в письме Минфина России от 05.03.2014 № 03-07-15/9519 (разослано по нижестоящим налоговым органам письмом ФНС России от 08.04.2014 № ГД-4-3/6398@).
Об этом финансовое ведомство говорило и ранее
Источник its.1c.ru