В письме от 29.06.2012 № 03-07-11/177 Минфин России рассмотрел следующую ситуацию. Организация была реорганизована в форме присоединения. До реорганизации она восстанавливала НДС по объекту недвижимости, используемому в необлагаемой деятельности. Должен ли правопреемник продолжать восстанавливать налог, если объект недвижимости в дальнейшем используется в указанной деятельности?
Финансовое ведомство разъяснило, что согласно п. 2 ст. 58 ГК РФ при присоединении одной организации к другой организации к последней переходят права и обязанности присоединенной организации в соответствии с передаточным актом. Поэтому если объект недвижимости, полученный правопреемником, используется для необлагаемых операций, он должен восстановить НДС, принятый к вычету организацией до присоединения. При этом налог восстанавливается в порядке, предусмотренном п. 6 ст. 171 НК РФ, то есть до окончания десятилетнего срока, начиная с года, в котором стала начисляться амортизация по этому объекту в налоговом учете.
Также Минфин России отметил, что п. 8 ст. 162.1 НК РФ, согласно которому НДС по основным средствам, принятый к вычету реорганизованной организацией, правопреемником не восстанавливается, в данном случае не применяется, так как распространяется не на использование этого объекта правопреемником, а на момент передачи ему.
См. всю информацию о восстановлении НДС на сайте ИТС