Выставление отрицательных счетов-фактур действующим налоговым законодательством не предусмотрено. Такой вывод изложен в письме Минфина России от 02.08.2010 № 03-07-09/41.
Отметим, что по данному вопросу есть и другая точка зрения. Выставление отрицательных счетов-фактур прямо законодательством не запрещено. Если их оформление не приводит к необоснованному возмещению (возврату) НДС из бюджета, указанный порядок можно считать правомерным.
Имеются судебные решения, подтверждающие обозначенный подход (см., например, постановления ФАС Московского округа от 18.08.2009 № КА-А40/7946-09, Поволжского округа от 10.02.2010 № А55-15001/2009).