Поскольку основное средство находится на реконструкции, то амортизация по нему не начисляется.
Ввод начальных остатков по таким ОС осуществляется в обычном порядке, то есть указывается порядок погашения стоимости "Начисление амортизации" на закладках "Бухгалтерский учет" и "Налоговый учет" (в форме ввода новой строки в табличной части документа). Для того чтобы амортизация не начислялась необходимо снять флажок "Начислять амортизацию".
Когда реконструкция будет завершена, необходимо ввести документ "Изменение состояния ОС" (меню "ОС и НМА" - "Параметры амортизации"), в котором поставить флажки "Влияет на начисление амортизации" и "Начислять амортизацию".