Иногда при второй установке программа предлагает не указать новый каталог, а переустановить ранее установленную программу. Здесь дело в следующем.
Система "1С:Предприятие" состоит из двух частей - программных файлов (они находятся в каталоге BIN) и файлов конфигурации. Локальную версию программы, действительно, можно установить только в один каталог. При ее установке в системном реестре Windows сохраняется адрес установки. При переустановке программа будет обновлена по этому адресу.
Конфигурацию (базу данных) - а именно она нужна для ведения нескольких бухгалтерий, можно устанавливать несколько раз в разные каталоги. Для этого достаточно стандартным образом установить типовую конфигурацию, указав при этом новый каталог (не тот, который предлагается по умолчанию). При этом в перечне информационных баз (который также хранится в системном реестре Windows) появятся новые строки, соответствующие установленной конфигурации.
