Честно говоря мне не удалось смоделировать ситуацию, когда у пользователя с полными правами из операции документ открывался в режиме отличном от указанного в Сервис-Параметры (вне зависимости откуда открывалась операция). Т.ч. проверяем все возможные варианты: права, настройки, релиз ядра 1С.