Распределение НДС с расходов

Добрый день.
Подскажите как правильно отразить в учете следующую ситуацию:
В организации одна оптовая точка (склад), и две розничных (магазины).
Соотвественно есть расходы, которые невозможно прямо отнести к операциям,облагаемым НДС, либо необлагаемым. Если я правильно понял необходимо собрать всю выручку по ЕНВД, всю выручку по неЕНВД, взять пропорцию, и согласно ее часть НДС к возмещению, часть на расходы.
Прав ли я?