Вопрос по выплате ЗП не зависимо от конфигурации

Помогите, пожалуйста, разобраться в такой ситуации. Сотруднику выплатили аванс, а он всю вторую половину месяца проболел. Когда ему начислили ЗП, то она оказалась меньше аванса, так вот бухгалтер говорит, что НДФЛ должен начисляться с суммы аванса, а не с начисленной ЗП. Правильно ли это?

Да, правильно.

А чем это обосновано, и как это реализовать в программе 1С 77 ЗиК?

Основание - Налоговый кодекс. Месяц закончился. Иванов за месяц получил денежные средства в рамках трудовых отношений с организацией. Организация есть налоговый агент. НДФЛ 1-го числа следующего м-ца следует перечислить в бюджет. В программе удержите с Иванова НДФЛ. Потом отразите погашение задолженности по бюджету. Я не совсем понимаю, что Вас интересует, даты, проводки?

Интересует, почему нельзя оставить НДФЛ, как рассчитала программа, а переплаченную сумму перенести как отрицательное начальное сальдо на следующий месяц, как это реализовано в программе.

Я бы в программе все оставила так, как там реализовано. Суть в том, чтобы сумма налога НДФЛ в бюджет была уплачена в срок и полностью.