Помогите!! В формах КС-2 указан НДС

Наша фирма занимается генподрядом и находится на упрощенной системе налогообложения. В 2008г. на аукционе был выигран лот, в сметной документации этого лота был указан НДС. В начале розыгрыша лота задавался вопрос : "что будем делать с НДС", на что ответ прозвучал так какую сумму выиграете та и ваша Поэтому финотдел не принял формы КС-2 без указания НДС. Мы с ними согласились, но все происходило в устной форме. В начале розыгрыша лота задавался вопрос : "что будем делать с НДС", на что ответ прозвучал так какую сумму выиграете та и ваша. Сейчас нас проверяет КРУ и очень быстро находит НДС в документах, хотя сам НДС ни где не указан, не в КС-3 не платежных документах Заказчика, не в муниципальном контракте и счет-фактуру мы не выписывали, да и в наших КС-2 сам НДС указан со многими нарушениями. Т.К. Цена договора твердая то к аукционной документации применили коэффициент договорной цены, но уже после строчки выделенного НДС, тем самым, занизив сумму самого НДС. Как теперь исправить документы? и чем нам грозит все это, если мы не исправим документы. Как доказать что выделенный НДС это не налог , а получается не верно указанный нами коэффициент.