Во-первых, проверьте релиз отчетности, должен быть 11q4002 (кнопка на форме, как только откроете рег.отчеты).
Во-вторых, попробуйте явно выгрузить бух.отчетность:
Выгрузка данных отчетности (форматы версии 4, версии 5)
отметить только "Бухгалтерская отчетность (с 2011 года) (версия 5.02)"
и посмотреть, какие сообщения выдаст выгрузка.