Простой на территории РФ - с НДС или нет?

Добрый день!
Я работаю в транспортно-экспедиторской организации, оказывающей транспортные услуги, в том числе и на территории Российской Федерации.
В 1 квартале 2015 года были оказаны услуги на грузоперевозку по территории РФ, которые облагаются 18% ставкой НДС, в том числе был выставлен счет за простой автомобиля.
Сейчас компания-заказчик отказывается оплачивать штраф за простой, так как он выставлен с 18% НДС. В законодательстве не удалось найти однозначную точку зрения, стоит ли выделять 18% с суммы простоя или нет. Есть только рекомендации в письмах Минфина, которые не являются обязательными, поэтому заказчик не принимает их во внимание.
Декларация по НДС уже подана, и мой вопрос заключается в том, можно ли клиента убедить в том, что мы имеем право выставить счет с НДС, чтобы не исправлять документы и не подавать уточненку?
Заранее спасибо за ответы

tatianak, а как выделение (или не выделение) НДС в счете на "претензию" может влиять на отчетность?

Рисовод, в том числе просят переделать и счет-фактуру