Деление НФДЛ на несколько строк в документе "Отражение зарплаты в регламентированном учете"

Зарплата и Управление Персоналом, редакция 2.5 (2.5.120.1)
1С:Предприятие 8.3 (8.3.7.1776)

Здравствуйте. Возникла следующая проблема.
Некоторые сотрудники оформлены как по основному месту работы, так и по ГПД. При заполнении документа "Отражение зарплаты в регламентированном учете" оплата по ГПД садится в "Дополнительные начисления", основная зарплата на вкладку "Основные начисления". Если у такого сотрудника есть надбавки или оплата компенсаций, то соответственно на вкладке "Основные начисления" формируются несколько строк. Например:

Оклад по часам       Сумма 1
Надбавка за стаж       Сумма 2

На вкладке "Дополнительные начисления" по сотруднику остается 1 строка с суммой по ГПД,
При формировании проводок данного документа НДФЛ делится не только по основным начислениям(логично, сумм же несколько), но почему-то и по дополнительным, т.е. НДФЛ с оплаты по ГПД делится, выделяются какие-то копейки.

Бухгалтер утверждает, что это ошибка, что не должен делиться НДФЛ с оплаты по ГПД. В регистрах "Расчеты налоговых агентов с бюджетом по НДФЛ" и "НДФЛ расчеты с бюджетом" суммы сидят верные. 1 сумма по основному начислению, 2 сумма по дополнительному начислению.

Помогите, пожалуйста, разобраться в этом вопросе. Допускается ли такое разделение или это ошибка ведения учета/программы?

Вполне возможно, что есть ошибки и в программе, но Вам следует проанализировать, что происходит у Вас.
А то в начале две суммы по основным начислениям и одна по ГПД, а в конце - ровно наооборот!?
Потом эти "копейки" - это что?

Сопоставьте случаи, когда есть деление суммы за счет НДФЛ и когда этого нет (или у всех сотрудников все одинаково) - хоть чем-то они должны отличаться; подобные "непонятки" возникают, когда есть льготные вычеты по НДФЛ, или другие отклонения.

Лучше было бы проблему описать конкретнее, например, для двух сотрудников и обрисовать её в картинках.

Анастасия Сычева, как минимум, ведется в разрезе подразделений. Вот и посмотрите, что там с подразделениями.