оформление командировок о новым правилам

Может ли предприятие не исключать использование командировочного удостоверения, указав в учетной политике необходимость его оформления?  Будет ли в этом случае командировочное удостоверение являться документом, подтверждающим факт нахождения сотрудника в командировке в целях налогового и бухгалтерского учета?

Да, конечно, предприятие может оставить в своем документообороте командировочное удостоверение, которое в совокупности с иными оправдательными документами будет подтверждать произведенные расходы. См. ответы на похожие вопросы:  
https://buh.ru/forum/forum19018/topic85273/,
https://buh.ru/forum/forum19018/topic85278/,
https://buh.ru/forum/forum19018/topic85308/.