Как следует из письма Минфина России от 14.08.2007 № 03-07-15/120, если имущество похищено и виновные лица установлены, это следует рассматривать как реализацию товаров и, соответственно, как объект обложения НДС. А значит, восстанавливать НДС по такому имуществу, ранее правомерно принятый к вычету, не нужно.
Если же виновных лиц найти не удалось и имущество выбыло в связи с потерей (порчей, боем, хищением, стихийным бедствием и т. д.), такая операция объектом налогообложения НДС не является. Следовательно, «входной» НДС по такому имуществу придется восстановить. Сделать это нужно в том налоговом периоде, в котором недостающее имущество списывается с учета. Если было украдено амортизируемое имущество, восстанавливать НДС надо в сумме, пропорциональной остаточной (балансовой) стоимости имущества без учета переоценки.