Такое мнение изложено в письме ФНС России от 30.09.2011 № ЕД-4-3/16146@ и основано на следующем.
Согласно ст. 2 Протокола о порядке взимания косвенных налогов и механизме контроля за их уплатой при экспорте и импорте товаров в Таможенном союзе от 11.12.2009 при импорте товара налогоплательщик обязан представить в налоговый орган налоговую декларацию, документы, на основании которых данный товар приобретен (в частности, договоры), и уплатить НДС.
В то же время передача товаров головной организацией, находящейся на территории Республики Беларусь, в ее российский филиал не является, с одной стороны, реализацией товара, с другой - их приобретением. При этом отсутствует договор, согласно которому филиал уплачивает стоимость товара головной организации, а значит, НДС не уплачивается.
Таким образом, налоговая декларация по косвенным налогам и заявление о ввозе товаров и уплате косвенных налогов в ИФНС не предоставляются.