НДФЛ-2 2009 год в ЗиУП 8.1 ред. 2.5.19.3

При формировании отчетности образуюся суммы неудержанного НДФЛ. Начисление в справках и сводной ведомости соответствует действительности, а вот удержание - нет. Перепроведение Ведомостей начисленной з/п ничего не дало. Где отражается удержание НДФЛ?

у вас в настройках, видимо, не стоит галочка "Упрощенный учет НДФЛ (начисленный = удержанному)". при
этом НДФЛ удерживается при выплате зп. так что перепроводите платежки и ордера.
а вот если бы эта галочка стояла, удерживался бы сразу, как начислялся.