НДС по векселю повторно (в след. периоде) встает к возмещению

Здравствуйте. Еще по результатам 1 квартала заметили неточность, тогда не стали придавать большое значение, но во втором квартале ситуация выходит из-под контроля совсем )
Программа Бухгалтерия 3.0.51.12, платформа 8.3.8.2054.
Был получен вексель банка от покупателя в счет последующей поставки нами им продукции (т.е. был получен аванс в виде векселя). Получен был 7 марта 2017 г. В марте же, если
Все необходимые операции по учету векселя и движению по НДС были проведены, в регистры НДС покупки и продажи всё как надо попало, в Книги за 1 квартал попало тоже.
В 1 квартале единственное что смутило (но тогда оставили "разобраться на потом") - некрасивое поведение "рыжей таблицы" ("Анализ состояния налогового учета по НДС"). Сумма справа неверная, меньше ровно на НДС аванса с векселя (сравниваем с 76АВ)) - скрин 1. Отгрузка была тогда же, т.е. аванс зачелся еще в 1 квартале. Правда, не весь. Часть средств осталась и ее вернули покупателю, но уже во 2 квартале.
Мы в полной уверенности, что уже отбрботали тот НДС - собираем отчет за 2 квартал. И в Формирование записей книги покупок (зачет авансов) снова выскакивают записи по векселям, и кстати снова с незаполненным полем "документ" (куда в 1 квартале подтягивали счет-фактуры). (скрин 2 - картина по 1 кварталу, скрин 3 - 2 квартал).
Хотелось бы понять, что мы делаем не так, скажите, какие нужны скрины может быть, вроде всё делаем по инструкции, перепроверяли неоднократно - всё красиво, все счета закрылись и отчеты собрались, кроме вот этой ситуации.
Если что-то путано написала - прошу прощения, уточните что непонятно ) Отвечу на все вопросы, лишь бы разобраться с этой ситуацией.

Обнаружили еще малопонятный разбег по 76АВ по документам. Может, причина в этом? Без аналитики по документам всё закрылось.
Спасите, умные люди...