Скажу честно - по Бухгалтерии не специалист, но специалист по УРБД. Сейчас взглянул на Бухгалтерию - мой вывод такой - надо править конфигурацию таким образом, чтобы при работе в ЦБ подставлялся счет 50.1, а при работе в ПБ подставлялся счет 50.2. Но это сугубо мое ИМХО.