Воспроизвести ситуацию можно следующим образом.
Начисляем зарплату за январь 2023 года, выплачиваем 31.01.2023
15 февраля 2023 начисляем аванс за февраль.
20 февраля перечисляем НДФЛ за январь документом Перечисление НДФЛ в бюджет отражаем документом, введенным на основании выплаты зарплаты на т.е. в табличной части документа по перечислению НДФЛ есть привязки к конкретным платежным ведомостям.
Казалось бы все очевидно, перечисленным должен стать НДФЛ удержанный в платежной ведомостью января 2023, но программа работает иначе.
Если в документе Перечисление НФД в бюджет реквизит ДатаПлатежа>=14.02.2023 (дата появления нового дохода плюс один день), то перечисленный НДФЛ разбивается пропорционально на доходы января и февраля. Ссылки на конкретную платежную ведомость игнорируются, можно снимать или ставить галку "Перечислен налог, удержанный конкретными документами (ведомостями)" - на результат это не влияет.
Если поставить ДатаПлатежа 13.02.2023 или более раннюю дату, то программа начинает работать корректно.
Проверялось на релизе 3.1.27.93, надеюсь что разработчики проблему исправят.