Восстанавливать НДС при раздельном учете нельзя. Хорошо об этом написано у Лапиной О.Г. в ее последней книге "Годовой отчет за 2005 год". Принимать к вычету можно только ту часть НДС, которая приходится на реализованную продукцию, облагаемую НДС. Остальная часть должна включаться в стоимость товаров, работ, услуг. Т.е. входящий НДС нужно распределять. В семерке автоматический учет таких операций не реализован. Либо нужно делать вручную, либо заказывать у франчей специальную обработку.