Помогите разобраться в учете

Есть заказчик:

Несколько розничных точек и оптовая база. Юридическое лицо одно. На некоторых розничных точках возможно вести количественный учет, на некоторых - весьма проблематично.Учетная политика по отгрузке.

Есть разные товары: у одних товаров ставка НДС 10%, у других - 20%. (Товары детского ассортимента и сопутствующие).

Приходуется товар на оптовый склад. При передаче в розницу мы должны передать НДС себестоимости на 41 счет. Но откуда его брать? С 19, с 68.2? К моменту передачи в розницу неизвестно, сколько НДС было взято к возмещению. Если брать с 19, то как потом возмещать при оплате поставщику?

Я пока делаю следующее при передаче в розницу:

Считаем, что весь НДС уже возмещен:

Дт 19.3 Кт 68.2

Дт 41.2 Кт 19.3

Но при этом начисляется к уплате в бюджет огромная сумма НДС.

В конце месяца корректировать НДС пропорционально отгрузке? Можно ли это делать при разных ставках НДС, и как вести книгу покупок?

Кроме того в рознице ведется учет по отпускным ценам, и нет возможности делать инвентаризацию так же часто, как меняются цены (большой ассортимент, цены меняются часто и на многие товары). Допустимо ли это вообще?