Начинающий бухгалтер

Народ скажите пожалуйста при закрытии квартала в оборотке появляется кредитовое сальдо по 40 сч, это нормально или нет? и куда его в баланс ставить

Кредитовое сальдо на 40 счёте не должно оставаться. Это не нормакльно.
Вы закрываете квартал, а разве есть документ "закрытие квартала"???
Есть документ "Закрытие месяца" и его надо вводить ЕЖЕМЕСЯЧНО, тогда никаких сальдушек не будет оставаться на 40 счете

А если программа закрывает месяц, а сальдо на 40 счете все равно остается?? тогда что

это значит что при закрытии месяца не выполняются процедуры по пересчёту плановой себестоимости продукции
с 20 счёта списываются фактические затраты, а зависшая сумма как раз и является отклонением между плановой себестоимостью и фактической.

почитайте внимательно инструкцию по применению плана счетов.
если вы обладаете хотя бы начальными знаниями в бухучёте, то должны помнить что счёт 40 является калькуляционным  счётом и в итогах баланса не участвует.

а если интересует порядок действий в 1С, то для начала неплохо было бы озвучить название конфигурации в которой вы ведёте учёт.