Перемещение товаров с оптового склада на розничный склад (НТТ)

БП 1.6.9.4
Организация ИП - ОСНО+ЕНВД, розница на ЕНВД. При формировании документов Перемещение товаров с оптового склада на розничный стоит признак включения НДС в стоимость товаров с отражением на счете 44.01. При проведении в части документов формируются проводки Дт 44.01 - Кт 19.03 только по части товарных позиций. Почему остальные не формируются - не могу понять, т.к. все остатльные параметры идентичны.
Кто-нибудь сталкивался с такой ситуацией?
При этом в регистре НДС по партиям запасов формируются записи по проиходу с плюсом и минусом, закономерности также не найду. Это вызывает неправильное формирование книги продаж нначиная со 2 квартала.

Там где нет проводки по включению НДС в стоимость, товар приходил с НДС? Вообще то надо разбиратьс с приходом,копать там сначала, а потом идти по всей цепочке документов

Да приходы были с НДС.