По ученическому договору физическому лицу, не являющимся работником организации, начисляется стипендия, т.к. это не является выплатой ни по трудовому договору, ни по гражданско-правовому, такая выплата в соотв. с положениями Закона №212-ФЗ, страховыми взносами не облагается. Стипендия лицу, не являющимся сотруднмком организации, по ученическому договору облагается НДФЛ.