Корректировочный счет-фактура в Бух.учет 4.5

да-да, это поняла!

вопрос теперь в другом: а исходный документ реализации или поступления менять надо? или надо новый выписывать?

ты сначала разберись как эти скидки отражаются в бух.учете "вообще". (лично я не сталкивался) Тогда, возможно, будет понятно и как это сделать в конфигурации.

Ситуация такая: в сентябре посутпил товар, оприходовали, НДС вычли, всё как полагается.
Дт 41.1 Кт 60.1 976287,46
Дт 19.3 Кт 60.1 175731,74
Дт 68.2 Кт 19.3 175731,74

В октябре выясняется, что кол-во и сумма были неправильные, поставщик выставляет КСФ с новыми данными. Сумма -11608,80
Опишу, что делает бухгалтер, а вы уж прокомментируйте, пожалуйста (только без троллинга)
1) в октябре заводит поступление товаров с минусом в кол-ве и сумме, проводка  Дт 41.1  Кт 60.1 -9837,97 (сумма без НДС)
2) на оснвоании поступления заводит КСФ так же с минусовыми суммами, затем ЗАпись киниги продаж, суммы аналогично, проводка Дт 19.3 Кт 68.2 -1770,83 (сумма НДС с минусом)
Всё.
В итоге на 60.1 зависает сумма равная сумме НДС и 19.3 расползается на сумму -1770,83

> на оснвоании поступления заводит КСФ так же с минусовыми суммами
суммы там всегда положительные на разницу НДС. А что надо с суммой сделать определяется переключателем "восстановление" или "вычет". В зависимости от этого и делаете на осн.этого с\ф запись либо книги покупок, либо продаж. По налоговому учету НДС все сделано. Можно проверить отчетами кн.покупок или продаж. А бух.проводки в связи с этим делают по-разному.
> В октябре выясняется, что кол-во и сумма были неправильные
ладно-бы цена изменилась, а неправильное количество - это как?

засада получается на 19.3

без разницы! Он из дока берет только дату с\ф (которую ты можешь и руками "вбить"), и конрагента с договорм (который у тебя одинаковй в обоих).

снимай галочку с проводок и делайте их бух.справкой.