Инвентаризация товаров

1. В вашей бы ситуации учет по складам в БП вообще отключить и разобраться хотя бы просто с количественными осттакми по организации в целом.
2. Если вам известен конечный остаток товара (по результатам инвентаризации), то проанализировав приход/расход этого товара по документам можно высчитать начальный остаток (количественный). Потом этот остаток нужно занести в ту дурацкую проводку вручную по вводу остатка и перепровести все товарные документы. Тогда списание суммы будет правильное.

ошибся, есть и количественный остаток. Например, указан материал, количество, склад, сумма.
далее идут обороты (количество и сумма), и обороты по перемещению  (указано количество, которое перенесено со склада1 на склад2)

Выкладывайте скриншоты ручной операции, настроек учета ТМЦ в общих настройках и учетной политике, а так же проводки документа, который, по вашему мнению, должен списать количество, но не списывает.

P.S. А то слишком часто вы ошибаетесь в своих же сообщениях...

обороты не добавлял. В течение нескольких месяцев поступали материалы (ручная проводка), перемещались со склада

Как вы считаете, по какой формуле должна рассчитываться стоимость списания товаров?

И как в этой формуле участвует цена закупки?

я понимаю, откуда в накладной такие цифры, меня интересует как скорректировать чтобы обратно вернулась прежняя цена.
Все изза этих ручных проводок. Может есть какие документы/регистры для корректировки состояния складов

Какая должна быть прежняя цена и почему она должна быть такая?

прежняя цена установленная документом "Установка цен номенклатуры".
До переключения режима на "по кол-ву и сумме" была такая

При перемещении не может использоваться цена, которую вы задаете, она должна рассчитываться. Если у вас на складе 5 шт на общую сумму 1250 руб, а вы ставите цену - 10руб, у вас от этого не измениться стоимость товара.
Стоимость единицы товара рассчитывается как Общая стоимость товара / количество товара.

Если до переключения на режим "по количеству и сумме" у вас была цена из цен номенклатуры, это было некорректно. Т.к. реальная цена ей не соответствовала.

когда меняю на "по количеству", цена в инвентаризации указывается как при установке цен. Несмотря на суммы поступлений