В случае приостановления налоговой проверки в связи с необходимостью проведения встречных проверок контрагентов налогоплательщика, налоговый орган не вправе проводить какие-либо мероприятия в отношении проверяемого налогоплательщика. Это подтверждено в постановлении ФАС Московского округа от 18.10.2010 № КА-А41/10859-10.
По материалам дела инспекцией было принято решение о приостановлении проведения налоговой проверки в связи с необходимостью истребования информации у контрагента налогоплательщика. В тот же день в адрес налогоплательщика было выставлено требование о предоставлении документов, которым обществу предложено в 10-дневный срок представить 22 наименования документов. Налогоплательщик обратился с заявлением о продлении срока исполнения требования, однако инспекторами было принято решение об отказе в продлении сроков. Суд указанное решение ИФНС, вынесенное в период приостановления проверки, признал незаконным.
О других аспектах проведения встречных проверок см., например, здесь.